Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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