Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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