Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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