Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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ECM1Q16610 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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