Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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