Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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SEC23BQ15437 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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SEC23BQ15437 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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SEC23BQ15437 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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