Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RFTN1Q14699 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms