Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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