Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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