Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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