Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NME3Q13232 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms