Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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