Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms