Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms