Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms