Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CENPFP49454 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CENPFP49454 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CENPFP49454 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms