Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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