Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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