Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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COPS7AQ9UBW8 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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COPS7AQ9UBW8 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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COPS7AQ9UBW8 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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COPS7AQ9UBW8 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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COPS7AQ9UBW8 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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COPS7AQ9UBW8 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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COPS7AQ9UBW8 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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COPS7AQ9UBW8 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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