Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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DTX3Q8N9I9 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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DTX3Q8N9I9 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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DTX3Q8N9I9 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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DTX3Q8N9I9 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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DTX3Q8N9I9 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DTX3Q8N9I9 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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