Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC022639.1-201ENST00000523191 573 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 C12orf73-203ENST00000546540 590 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MPHOSPH6-207ENST00000569021 392 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC133565.1-201ENST00000569218 488 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SL670P-201ENST00000577235 294 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF677-208ENST00000599012 796 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC245028.3-201ENST00000618197 285 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 UBE2R2-AS1-201ENST00000454429 647 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP290-201ENST00000606842 195 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.165-201ENST00000615681 260 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MIR6785-201ENST00000618984 81 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL158175.1-201ENST00000634327 1127 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms