Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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