Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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VAMP3Q15836 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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VAMP3Q15836 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
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VAMP3Q15836 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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VAMP3Q15836 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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VAMP3Q15836 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
VAMP3Q15836 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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