Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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