Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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