Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms