Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
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