Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NEUROD1Q13562 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms