Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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