Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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FOXC1Q12948 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXC1Q12948 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXC1Q12948 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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FOXC1Q12948 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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