Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCAMP43121 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCAMP43121 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms