Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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CEP290O15078 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CEP290O15078 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CEP290O15078 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CEP290O15078 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CEP290O15078 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CEP290O15078 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CEP290O15078 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CEP290O15078 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CEP290O15078 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CEP290O15078 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CEP290O15078 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CEP290O15078 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CEP290O15078 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CEP290O15078 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CEP290O15078 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CEP290O15078 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
CEP290O15078 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
CEP290O15078 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CEP290O15078 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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