Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms