Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb6Q9Z0T9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb6Q9Z0T9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb6Q9Z0T9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms