Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Col4a4Q9QZR9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Col4a4Q9QZR9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms