Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms