Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms