Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop56Q9D6Z1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms