Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms