Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms