Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3bpQ9CQ82 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms