Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce3Q9CPR8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms