Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms