Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacs1Q8K212 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs1Q8K212 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms