Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cnppd1Q8K158 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cnppd1Q8K158 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cnppd1Q8K158 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cnppd1Q8K158 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cnppd1Q8K158 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cnppd1Q8K158 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cnppd1Q8K158 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cnppd1Q8K158 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cnppd1Q8K158 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cnppd1Q8K158 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnppd1Q8K158 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnppd1Q8K158 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms