Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms