Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf3Q8BYK6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms