Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms