Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim19Q80ZU4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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