Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms